TCCR1B = TCCR1B_value; //В настройке таймера

const uint16_t static Timer1Presdcaler(void){ //256,1024
    switch(TCCR1B_value & 0b00000111){
        case 0b00000000: return 0UL;
        case 0b00000001: return 1UL;
        case 0b00000010: return 8UL;
        case 0b00000011: return 64UL;
        case 0b00000100: return 256UL;
        case 0b00000101: return 1024UL;
    }
    return 0;
}

#define Timer1Freq F_CPU/Timer1Presdcaler()
#define Tick2Wait(s) (Timer1Freq*s)

    uint32_t tmp=Tick2Wait(60*15); //так-то Tick2Wait() возвращается u32
    printf(" F_CPU= %u",tmp>>16);
    printf(" F_CPU= %u",tmp);
    
    CheckChargeMult = tmp / my_USHRT_MAX;//тип не мощнее uint16_t
    if (CheckChargeMult==0) {
        uint16_t currentTime = TCNT1;
        OCR1A = (my_USHRT_MAX-currentTime>tmp) ? tmp-(my_USHRT_MAX-currentTime) : tmp;
        
    }
    else CheckChargeTrigger=true;
    
    //Код overflow
    if (CheckChargeTrigger)
    if (CheckChargeMult==0) {
        uint16_t currentTime = TCNT1;
        OCR1A = (my_USHRT_MAX-currentTime>tmp) ? tmp-(my_USHRT_MAX-currentTime) : tmp;
        TIMSK1|=(1<<OCIE1A);//вкл OCR interaption//тут можно проверить, не активирована ли он уже (не занят ли кем-то) if (TIMSK1 & (1<<OCIE1A)) то занят
        }
    else CheckChargeMult--;

    //Код OCR
    //PortA=... делаем действие
    CheckChargeTrigger=false;
    TIMSK1&=~(1<<OCIE1A);//выкл OCR

Сделаем аналог delay_s, но с возможностью параллельно что-то делать в цикле, своего рода задача-бездействие. Для этого нам понадобится таймер. Возьмём Timer1 с его 16битным счётчиком TCNT1.

                //задержка на 2
               u16 alarm=GetOCR(Tick2Wait(2))-1;//-1 на случай, если TCNT1==alarm даже после исполнения нескольких команд (вдруг таймер ультра-слоупок), из-за этого погрешность в 1 тик.
                do{
                    externalSupplyLevelADC = adc_read_10bit(ADC_MUX_ADC6, ADC_VREF_AREF);
                    if (externalSupplyLevelADC<externalSupplyLowLevelADC) //смотрим АЦП
                    {};//что-то делаем
                }while(TCNT1!=alarm);

Погрешность 1 тик есть 1/частота таймера. Например, если частота таймера 3600 Hz (это медленный таймер), то погрешность в 1 тик - это 1/3600~0.28 ms.